Paano nagwakas ang digmaanng Filipino-Amerikano?

   Hinarang ng mga tauhan ni Koronel Frederick Funston ang ilan sa mga liham ni Aguinaldo sa kanyang mga heneral upang mahuli siya. Si Funston ay nagsinungaling ng pirma ng isang heneral na Aguinaldo at nagpahayag na magpadala ng mga karagdagang tropa sa kampo ni Aguinaldo.

     Dinala si Aguinaldo sa Maynila matapos siyang arestuhin. Nagpahayag si Aguinaldo ng katapatan sa Estados Unidos noong Abril 1, 1901. Dagdag pa rito, naglabas ito ng proklamasyon na humihimok sa mga Pilipino na tanggapin ang kontrol ng US sa bansa.

     Maraming rebolusyonaryong Pilipino ang sumuko sa US nang mahuli si Aguinaldo. Ang pakikidigmang gerilya ay ipinagpatuloy din ng ilan. Ang pamahalaan ni Aguinaldo ay pinamunuan ni Heneral Miguel Malvar.
 
     Noong Setyembre 28, 1901, sinalakay ng mga rebeldeng pinamumunuan ni Heneral Vicente Lukban ang kuta ng mga Amerikano sa Samar. Nagresulta ito sa pagkamatay ng 54 na sundalong Amerikano. Ipinag-utos ni Heneral Jacob F. Smith na patayin at sunugin ang lahat ng nagmamay-ari o may kakayahang humawak ng sandata, kabilang ang mga kabataang lalaki na may edad sampu pataas, bilang ganti sa pag-atake. Balangiga Massacre ang tawag sa malagim na pangyayaring ito. Noong Pebrero 17, 1902, nahuli si Lukban.

Sumuko si Malvar noong Abril 16, 1902 sa US.