Sa Cavite, nagkaroon ng tunggalian sa pagitan ng dalawang paksyon ng Katipunero, ang Magdalo at ang Magdiwang, bago pa man nagsimula ang himagsikan. Ang salungatan na ito ay nagmula sa kawalan ng paggalang at pagiging mapagkumpitensya sa teritoryo. Si Baldomero Aguinaldo (kamag-anak ni Emilio Aguinaldo) ang namuno sa Magdalo, na pinatibay sa Cavite el Viejo (Kasalukuyang Kawit). Pinalakas naman ni Magdiwang si Noveleta at naniwala sa pamumuno ni Bonifacio sa pamumuno ni Mariano Alvarez.
Noong Disyembre 31, 1896, isang kombensiyon ang ginanap sa Imus upang ayusin ang isyu sa pagitan ng dalawang organisasyon. Naniniwala ang grupong Magdalo na ang Katipunan ay kailangang palitan ng bagong pamunuan na may kakayahang harapin ang mga kahilingan ng isang rebelyon. Ito ay direktang pagsalungat sa paniniwala ni Magdiwang. Natapos ang pagpupulong nang hindi nagkasundo ang dalawang paksyon.
